روش تبدیل تصاویر ct scan به فرمت 3D و قابل نمایش در برنامه های Blender یا Meshlab

با سلام

//////////

پیش از شروع : جهت اموزش برنامه های ITK snap  و MeshLab میتوانند به ادرس های زیر در سایت یوتیوب youtube مراجعه نمایند :

ITK snap : https://www.youtube.com/channel/UCmjrCaGMtwwBXppAberTrjg/videos

Meshlab : https://www.youtube.com/user/MrPMeshLabTutorials/videos

\\\\\\\\\\

پیش از شروع مجموعه تصاویر سی تی اسکن خودتونو در یک فولدر قرار داده برنامه MRIconvert اجرا کنید :

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

همانگونه که از روی شکل مشخص شده با انتخاب add files میتوانید به پوشه مورد نظر رفته و تمامی تصاویر سی تی را انتخاب کرده و سپس ok را انتخاب نمایید. در قسمت پایین با انتخاب directory میتوانید مسیر فایل تبدیل شده را انتخاب نمائید، توجه کنید که فرمت فایل میبایستی همانند فرمت فایلی که در تصویر بالا انتخاب شده باشد سپس convert all را انتخاب کنید. فایل تبدیل شده بصورت زیر در پوشه ذخیره خواهد شد :

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

اکنون میتوانید برنامه ITK Snap را اجرا کنید و از منوی بالا فایل را انتخاب کرده سپس open image را کلیک کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس تصویر زیر را مشاهده خواهید کرد

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

در ادامه با توجه به شکل ها عمل کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

گزینه ها را مطابق با آنچه روی شکل تایین شده انتخاب نمائید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

با انتخاب finish به قسمت بعد کار خواهیم پرداخت

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس گزینه snake رو فعال کنید و یک محدوده برای فضای کارتان انتخاب کنید ، این محدوده همان خط چین هایی هستند که اطراف تصویر سی تی در شکل میبینید ضمنا توجه داشه باشید که شما میتوانید با حرکت دادن نشانگر موس و یک ابزار در قسمت سمت راست تصاویر در فضای تصاویر حرکت کنید و تمامی بخش ها را مشاهده کنید حتی با احیا یا دستکاری نوع نمایش بخش هایی را نادیده یا ظاهر کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

بعد از اینکه محدوده را تایین کردید گزینه segment 3D را انتخاب کنید 

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس به مرحله اول کار وارد میشوید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

در این بخش در چند حالت مختلف نحوه نمایش و توانایی های گزینشی این برنامه را در تصاویر زیر نمایش میدهم البته کاربر برحسب نوع نیازمندی میتواند گزینش مناسبی داشته باشد

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

دوباره برمیگردیم به تصویر اولی که داشتیم در این قسمت میتوانید استانه را تغییر دهید و بخش هایی را که لازم ندارید محو کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

اگر توجه کرده باشید قبلا گفتم که میتوانید جای جای تصویر سی تی را با گزینه ای در قسمت سمت راست پنجره مشاهده کنید در تصویر زیر مشخص شده 

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس با انتخاب next به مرحله بعدی خواهیم رفت

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

در این قسمت شما باید با استفاده از کروسور موس روی بخش هایی که تمایل دارید بصورت سه بعدی تبدیل شوند کلیک کنید و نشانگر را روی هر بخش با استفاده از موس ببرید و سپس add bubble at cursor را انتخاب نمایید توجه داشته باشید که در سه بعد میبایستی این حباب ها را قرار دهید

برای دقت در این امر هم میتوانید شعاع این حباب ها را تغییر دهید

برای مشاهده تصویر  بزرگتر کلیک کنید

اگر حبابی را اشتباه وارد کردید از جدول کنار سمت راست میتوانید ان را گزینش و حذف کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس با انتخاب Next به مرحله پایانی وارد میشویم

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

در صورتی که تمام بخش های مورد نظر را انتخاب کرده اید میتوانید Finish را انتخاب کنید

در این بخش میتوانید پیش نمایشی 3 بعدی را از این گزینش ها را در پنجره پایین سمت چپ با انتخاب ایکون گزینه play و سپس pause ان و کلیک کردن روی update پایین همان پنجره نمای سه بعدی رو ببینید 

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس برای ذخیره فایل طبق شکل زیر عمل کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

از منوی بالا segmentation را انتخاب کنید سپس export as surface mesh را گزینش کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس Finish را انتخاب نمایید و فایل ذخیره خواهد شد دقت کنید گزینه ها مطابق شکل انتخاب شده باشند

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

سپس برنامه MeshLab را اجرا کنید 

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

در نهایت تصویر زیر  را خواهیم دید / البته بدلیل اینکه تمام بخش ها را گزینش نکرده بودم تصویر ناقص نشان داده میشود اما اگر بخش خاصی را انتخاب و ان را تماما گزینش کنید ان عضو یا اندام تماما بصورت 3 بعدی ترسیم خواهد شد

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

اما این پایان کار نیست شما میتوانید در همین برنامه که پایه و اساس مشبندی دارد ادامه دهید و یا اینکه در محیطی دیگر همانند Belender با این فایل کار کنید

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

البته در بلندر امکان تبدیلفایل سه بعدی به voxel وجود دارد منتها در ان بخش باید خروجی را برای کدهایی مثل mcnpx مهیا کرد

برای مشاهده تصویر بزرگتر کلیک کنید

با تشکر از توجه شما

علی اصغر محمدزاده

گروه پژوهشی افق امید نو

Download Reflection 11

Reflection 11 is another geometry plotter that you can use it with MCNP code for all series 4C - X

Link for Download

Contact email : [e-mail]

Njoy 97

با سلام خدمت دوستان گرامی

از اینکه صفحه وبلاگ این شکلی شده عذرخواهی میکنم بزودی تغییراتی در

نحوه ارائه مطالب و نوع مطالب خواهم داد که هم شما مخاطب گرامی راحت تر باشید

و هم خیال ما اسوده تر بشه از باب تکلیف

بهر حال ؛ این کد رو اقای بهادرزاده محبت کردند در اختیار ما قرار دادند تا سایر دوستان

که دسترسی به این کد ندارند بتوانند از آن استفاده کنند .

اگه تونستیم نسخه 99 این کد رو هم در این سایت قرار خواهیم داد.

--------------------------------------------------------------------------

Hello

i am sorry because of the first page of my blog and Adds

in close feature i will rearrange them and make it easier

for everyone to search among pages

This is Njoy 97 and if it was possible we could post version 99

of this Code in next days

thank you

------------------------------------------------------------------

دانلود کنید

Download it

From 4shared

Dpm Download link

اقای اوسط از اینکه خبردادید فایل ایراد داره از شما ممنونم

دانلود DPM 11 

Download DPM 11

GUIMC - Download Graphical User Interface

میتوانید این برنامه GUIMC را دانلود کنید + کتابخانه ویندوز که میبایست محتویات این فایل را در پوشه windows درایو اصلی - درایوی که ویندوز در ان نصب شده - قرار دهید در غیر این صورت سیستم پیام خطا میدهد همچنین این برنامه قابلیت ویرایش سورس و اعمال دستورات را در محیط خودش داره و پیشنهاد میکنم خودتون امتحان کنین نسخه ویندوز و نسخه اوبونتو را با هم قرار دادم حجمش برای ویندوز 4 مگ بیشتر نیست سنخه مورد نظرتونو رجیستر و از ان استفاده کنید

لینک سایت مرجع این برنامه

you can Download GUIMC now + windows library for windows users

you must paste this files - windows library files - in windows folder at your main drive

note that this zipped file contain files of guimc in 2 os system linux obuntu and windows it's easy to set them up and there is a registration code in license file

GuiMC is a platform-independent front end for MCNP5 and MCNPX. It provides you an easy way to use MCNP and MCNPX without typing any commands. Are you tired dealing with black boring command window? Try GuiMC now!
Features
+ Input file editing
+ Syntax highlighting
+ Keyword auto-completion
+ Output file auto-open
+ Output file cleaning
+ Batch running
+ Parallel computing with MPICH2
+ Plotting
+ Cross platform -Linux and Windows, Maybe Mac in the future

here is the main link

Njoy 99

دانلود منوال انجوی 99 سه فایل مربوط به قسمت اول 15 مگ و فایل اخر 4 مگ است 

Download Manual of NJOY 99 in 4 part -3 part 15 mb and the last part 4 mb

Part 1

Part 2

Part 3

Part 4

Code System for Producing, Pointwise and Multigroup Neutron

and Photon Cross Sections from ENDFB Data

----------------------------------------------------------------------

برای متصل کردن فایل های بالا ابتدا برنامه پرتابل و کم حجم File splitter را دانلود کنید سپس طبق شکل part 1 انتخاب کنید 

For join this parts you must download portable file splitter and then continue like pictures

دانلود نرم افزار کمکی Radiation Tool Box

میتوانید این نرم افزار را از این لینک دانلود کنید

you can download Radiation Tool Box from Here

توضیحات

Descriptions

شما میتوانید در قسمت ضرایب دوز بر حسب مورد مثلا ضرایب دوز ICRP 68 که لازم دارید این ضرایب را در اختیار بگیرید ابتدا نوع چشمه خود را انتخاب کرده و سپس Display را انتخاب کنید

you can chose dose coefficient tab and then select ICRP protocol then follow pictures

در قسمت محاسبه دوز هم میتونید اکتیویته چشمه را ذکر کنید و الباغی ماجرا دو تصویر زیر مربوط به محاسبه دز سزیم 127 با اکتیویته 2 میلی کوریه

in dose calculation tab you must write source activity . i try to show it in pictures bellow

و با انتخاب Display پنجره زیر باز میشود

+ این نرم افزار امکانات زیادی داره که میتونه در کنار کد mcnp یک کمک بسیار عالی بحساب بیاد

this is a useful software that could be helpful beside mcnp code

دانلود نرم افزار Tecplot Focuse 2009

you can download Tecplot focus 2009 for 32 bit windows OS

download all of the parts and then joined them with free file splitter you can download it at the end of the page

this is a program that i used it to plot my contour plots from mcnpx conversion methods -gridconve and ... - or in a simple sentence plot mdat files of mcnpx  / mesh plots

این نرم افزار هم قابلیت های انالیز داده ها رو داره و من بیشتر بخاطر گرفتن پلوت های کانتور از فایل mdat کد mcnpx از این نرم افزار استفاده میکنم پیش از این دو نسخه یکی پرتابل و دیگری نسخه 2005 رو برا دانلود گذاشته بودم این نسخه برای سیستم های 32 بیت قرار داده ام

=======================================

توضیحاتی در مورد برنامه File Splitter

ابتدا برنامه File Splitter را دانلود کنید ( این برنامه کم حجم است و نیازی به نصب ندارد مستقیما اجرا میشود ) سپس پنجره زیر را خواهید دید

First download File splitter and run it that is portable

write like this : E:\mcnp programming series\Tecplot.Focus.2009.R2.v12.1.0.6712-TBE.rar

تب join files را انتخاب کنید 

سپس در قسمت source chunk مکانی را که تکه ها را در انجا قرار داده اید با کمک brows باز و اولین تکه را انتخاب کنید مابقی تکه ها را بصورت اتوماتیک پیدا میکند سپس در قسمت destination file مکان جدیدی را تعریف کنید مثلا درایو e تا فایل نهایی را در این درایو قرار دهد نکته فرمت فایل را مانند تصویر rar بنویسید

 بعد از انجام این مراحل روی Join کلیک کنید پس از انجام فرایند اتصال تکه ها پیام زیر مبنی بر اتمام کار را مشاهده میکنید .

select join files and then in source chunk chose the first part of 9

in Destination file box write output address of file with Rar format just like the picture

دانلود نرم افزار origin lab 7

Download OriginLab 7

you can extract it with winrar and then setup it - for windows users - it has crack folder

download all the 9 parts and then use filesplitter to join all of parts

شما میتوانید این نرم افزار را که پیش از این کارهایی را در پست های قبلی روی داده ها انجام داده ایم در 9 قسمت 6 مگابایتی دانلود کنید و سپس با نرم افزار File Splitter انها را به هم چسبانده تا فایل زیپ حاوی بخش Setup , Crack ان ساخته شود سپس با Winrar فایل مربوطه را Extract کنید و برنامه را نصب و کرک کنید

part 1

part 2

part 3

part 4

part 5

part 6

part 7

part 8

part 9

---------------------------

نکته : تمام قسمت ها را میبایستی دانلود کرده باشید تا بتوانید با روش زیر فایل اصلی را بازسازی کنید

 You must be sure of downloading all the 9 parts

-------------

ابتدا برنامه File Splitter را دانلود کنید ( این برنامه کم حجم است و نیازی به نصب ندارد مستقیما اجرا میشود ) سپس پنجره زیر را خواهید دید

First download File splitter and run it that is portable

تب join files را انتخاب کنید 

سپس در قسمت source chunk مکانی را که تکه ها را در انجا قرار داده اید با کمک brows باز و اولین تکه را انتخاب کنید مابقی تکه ها را بصورت اتوماتیک پیدا میکند سپس در قسمت destination file مکان جدیدی را تعریف کنید مثلا درایو e تا فایل نهایی را در این درایو قرار دهد نکته فرمت فایل را مانند تصویر rar بنویسید

  بعد از انجام این مراحل روی Join کلیک کنید پس از انجام فرایند اتصال تکه ها پیام زیر مبنی بر اتمام کار را مشاهده میکنید .

select join files and then in source chunk chose the first part of 9

in Destination file box write output address of file with Rar format just like the picture

فاکتورهای تبدیل دوز Dose Conversion Factors

Dose Conversion Factors

دانلود از سایت اصلی

TABLE II-III. Committed Effective Dose Per Unit Intake via Inhalation and Ingestion (Sv/Bq) for Workers
TABLE II-VI. Committed Effective Dose Per Unit Intake via Ingestion (Sv/Bq) for Members of the Public
TABLE II-VII. Committed Effective Dose Per Unit Intake via Inhalation (Sv/Bq) for Members of the Public
TABLE II-IX. Committed Effective Dose Per Unit Intake via Inhalation (Sv/Bq) for Soluble or Reactive Gases and Vapours
TABLE II-X. Effective Dose Rate for Exposure to Inert Gases for Adults(a)

دانلود همه لینک های بالا بصورت زیپ شده کلیک کنید